seq1 = /home/httpd/html/group-files/cgi-bin/cDNA_fasta.txt, 2260 bp
seq2 = /home/httpd/html/group-files/cgi-bin/DNA_fasta.txt (RPS6KA3_DNA), 113812 bp

>U08316
>RPS6KA3_DNA

1-69  (1001-1069)   100% ->
70-126  (32819-32875)   100% ->
127-243  (58229-58345)   100% ->
244-325  (63530-63611)   100% ->
326-406  (72488-72568)   100% ->
407-486  (73365-73444)   100% ->
487-593  (74040-74146)   100% ->
594-631  (79099-79136)   100% ->
632-774  (79663-79805)   100% ->
775-845  (81267-81337)   100% ->
846-934  (90549-90637)   100% ->
935-999  (91135-91199)   100% ->
1000-1102  (91281-91383)   100% ->
1103-1227  (92345-92469)   100% ->
1228-1353  (94762-94887)   100% ->
1354-1443  (98142-98231)   100% ->
1444-1602  (99886-100044)   100% ->
1603-1764  (102573-102734)   99% ->
1765-1841  (104593-104669)   100% ->
1842-1959  (105872-105989)   100% ->
1960-2100  (111384-111524)   100% ->
2101-2260  (112113-112271)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGCTGGCGCAGCTGGCGGACCCGTGGCAGAAGATGGCTGTGGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   1001 ATGCCGCTGGCGCAGCTGGCGGACCCGTGGCAGAAGATGGCTGTGGAGAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCGTCCGACAGCGCTGAG         AATGGACAGCAAATTATGGATG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
   1051 CCCGTCCGACAGCGCTGAGGTG...CAGAATGGACAGCAAATTATGGATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AACCTATGGGAGAGGAGGAGATTAACCCACAAACT         GAAGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
  32841 AACCTATGGGAGAGGAGGAGATTAACCCACAAACTGTA...CAGGAAGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GTCAGTATCAAAGAAATTGCAATCACACATCATGTAAAGGAAGGACATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  58235 GTCAGTATCAAAGAAATTGCAATCACACATCATGTAAAGGAAGGACATGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AAAGGCAGATCCTTCCCAGTTTGAACTTTTAAAAGTATTAGGGCAGGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  58285 AAAGGCAGATCCTTCCCAGTTTGAACTTTTAAAAGTATTAGGGCAGGGAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CATTTGGAAAG         GTTTTCTTAGTTAAAAAAATCTCAGGCTCT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
  58335 CATTTGGAAAGGTA...CAGGTTTTCTTAGTTAAAAAAATCTCAGGCTCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GATGCTAGGCAGCTTTATGCCATGAAGGTATTGAAGAAGGCCACACTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  63560 GATGCTAGGCAGCTTTATGCCATGAAGGTATTGAAGAAGGCCACACTGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AG         TTCGAGACCGAGTTCGGACAAAAATGGAACGTGATATCT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  63610 AGGTA...TAGTTCGAGACCGAGTTCGGACAAAAATGGAACGTGATATCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 TGGTAGAGGTTAATCATCCTTTTATTGTCAAGTTGCATTATG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
  72527 TGGTAGAGGTTAATCATCCTTTTATTGTCAAGTTGCATTATGGTA...CA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    407  CTTTTCAAACTGAAGGGAAGTTGTATCTTATTTTGGATTTTCTCAGGGG
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  73364 GCTTTTCAAACTGAAGGGAAGTTGTATCTTATTTTGGATTTTCTCAGGGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 AGGAGATTTGTTTACACGCTTATCCAAAGAG         GTGATGTTCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
  73414 AGGAGATTTGTTTACACGCTTATCCAAAGAGGTA...TAGGTGATGTTCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 CAGAAGAAGATGTCAAATTCTACTTGGCTGAACTTGCACTTGCTTTAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  74050 CAGAAGAAGATGTCAAATTCTACTTGGCTGAACTTGCACTTGCTTTAGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 CATCTACATAGCCTGGGAATAATTTATAGAGACTTAAAACCAGAAAA   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
  74100 CATCTACATAGCCTGGGAATAATTTATAGAGACTTAAAACCAGAAAAGTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    594       TATACTTCTTGATGAAGAAGGTCACATCAAGTTAACAG      
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
  74150 ...CAGTATACTTCTTGATGAAGAAGGTCACATCAAGTTAACAGGTA...

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    632    ATTTCGGCCTAAGTAAAGAGTCTATTGACCATGAAAAGAAGGCATAT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  79660 CAGATTTCGGCCTAAGTAAAGAGTCTATTGACCATGAAAAGAAGGCATAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    679 TCTTTTTGTGGAACTGTGGAGTATATGGCTCCAGAAGTAGTTAATCGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  79710 TCTTTTTGTGGAACTGTGGAGTATATGGCTCCAGAAGTAGTTAATCGTCG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    729 AGGTCATACTCAGAGTGCTGACTGGTGGTCTTTTGGTGTGTTAATG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
  79760 AGGTCATACTCAGAGTGCTGACTGGTGGTCTTTTGGTGTGTTAATGGTA.

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    775      TTTGAAATGCTTACTGGTACACTCCCTTTCCAAGGAAAAGATCGA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  79810 ..TAGTTTGAAATGCTTACTGGTACACTCCCTTTCCAAGGAAAAGATCGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    820 AAAGAAACAATGACTATGATTCTTAA         AGCCAAACTTGGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
  81312 AAAGAAACAATGACTATGATTCTTAAGTA...TAGAGCCAAACTTGGAAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    861 GCCACAGTTTTTGAGTCCTGAAGCGCAGAGTCTTTTACGAATGCTTTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  90564 GCCACAGTTTTTGAGTCCTGAAGCGCAGAGTCTTTTACGAATGCTTTTCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    911 AGCGAAATCCTGCAAACAGATTAG         GTGCAGGACCAGATGGA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
  90614 AGCGAAATCCTGCAAACAGATTAGGTA...TAGGTGCAGGACCAGATGGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    952 GTTGAAGAAATTAAAAGACATTCATTTTTCTCAACGATAGACTGGAAT  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
  91152 GTTGAAGAAATTAAAAGACATTCATTTTTCTCAACGATAGACTGGAATGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1000        AAACTGTATAGAAGAGAAATTCATCCGCCATTTAAACCTGCAA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  91202 A...CAGAAACTGTATAGAAGAGAAATTCATCCGCCATTTAAACCTGCAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1043 CGGGCAGGCCTGAAGATACATTCTATTTTGATCCTGAGTTTACTGCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  91324 CGGGCAGGCCTGAAGATACATTCTATTTTGATCCTGAGTTTACTGCAAAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1093 ACTCCCAAAG         ATTCACCTGGCATTCCACCTAGTGCTAATGC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
  91374 ACTCCCAAAGGTA...CAGATTCACCTGGCATTCCACCTAGTGCTAATGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1134 ACATCAGCTTTTTCGGGGGTTTAGTTTTGTTGCTATTACCTCAGATGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  92376 ACATCAGCTTTTTCGGGGGTTTAGTTTTGTTGCTATTACCTCAGATGATG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1184 AAAGCCAAGCTATGCAGACAGTTGGTGTACATTCAATTGTTCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
  92426 AAAGCCAAGCTATGCAGACAGTTGGTGTACATTCAATTGTTCAGGTG...

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1228    CAGTTACACAGGAACAGTATTCAGTTTACTGATGGATATGAAGTAAA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  94759 TAGCAGTTACACAGGAACAGTATTCAGTTTACTGATGGATATGAAGTAAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1275 AGAAGATATTGGAGTTGGCTCCTACTCTGTTTGCAAGAGATGTATACATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  94809 AGAAGATATTGGAGTTGGCTCCTACTCTGTTTGCAAGAGATGTATACATA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1325 AAGCTACAAACATGGAGTTTGCAGTGAAG         ATTATTGATAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
  94859 AAGCTACAAACATGGAGTTTGCAGTGAAGGTA...TAGATTATTGATAAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1366 AGCAAGAGAGACCCAACAGAAGAAATTGAAATTCTTCTTCGTTATGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  98154 AGCAAGAGAGACCCAACAGAAGAAATTGAAATTCTTCTTCGTTATGGACA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1416 GCATCCAAACATTATCACTCTAAAGGAT         GTATATGATGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
  98204 GCATCCAAACATTATCACTCTAAAGGATGTA...TAGGTATATGATGATG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1457 GAAAGTATGTGTATGTAGTAACAGAACTTATGAAAGGAGGTGAATTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99899 GAAAGTATGTGTATGTAGTAACAGAACTTATGAAAGGAGGTGAATTGCTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1507 GATAAAATTCTTAGACAAAAATTTTTCTCTGAACGAGAGGCCAGTGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99949 GATAAAATTCTTAGACAAAAATTTTTCTCTGAACGAGAGGCCAGTGCTGT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1557 CCTGTTCACTATAACTAAAACCGTTGAATATCTTCACGCACAAGGG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
  99999 CCTGTTCACTATAACTAAAACCGTTGAATATCTTCACGCACAAGGGGTA.

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1603      GTGGTTCATCGAGACTTGAAACCTAGCAACATTCTTTATGTGGAT
        ..>>>||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100049 ..TAGGTGGTTCATAGAGACTTGAAACCTAGCAACATTCTTTATGTGGAT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1648 GAATCTGGTAATCCGGAATCTATTCGAATTTGTGATTTTGGCTTTGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102618 GAATCTGGTAATCCGGAATCTATTCGAATTTGTGATTTTGGCTTTGCAAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1698 ACAGCTGAGAGCGGAAAATGGTCTTCTCATGACTCCTTGTTACACTGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102668 ACAGCTGAGAGCGGAAAATGGTCTTCTCATGACTCCTTGTTACACTGCAA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1748 ATTTTGTTGCACCAGAG         GTTTTAAAAAGACAAGGCTATGAT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 102718 ATTTTGTTGCACCAGAGGTA...TAGGTTTTAAAAAGACAAGGCTATGAT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1789 GCTGCTTGTGATATATGGAGTCTTGGTGTCCTACTCTATACAATGCTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104617 GCTGCTTGTGATATATGGAGTCTTGGTGTCCTACTCTATACAATGCTTAC

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1839 CGG         TTACACTCCATTTGCAAATGGTCCTGATGATACACCAG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104667 CGGGTG...TAGTTACACTCCATTTGCAAATGGTCCTGATGATACACCAG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1880 AGGAAATATTGGCACGAATAGGTAGCGGAAAATTCTCACTCAGTGGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105910 AGGAAATATTGGCACGAATAGGTAGCGGAAAATTCTCACTCAGTGGTGGT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1930 TACTGGAATTCTGTTTCAGACACAGCAAAG         GACCTGGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 105960 TACTGGAATTCTGTTTCAGACACAGCAAAGGTA...CAGGACCTGGTGTC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1971 AAAGATGCTTCATGTAGACCCTCATCAGAGACTGACTGCTGCTCTTGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111395 AAAGATGCTTCATGTAGACCCTCATCAGAGACTGACTGCTGCTCTTGTGC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2021 TCAGACATCCTTGGATCGTCCACTGGGACCAACTGCCACAATACCAACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111445 TCAGACATCCTTGGATCGTCCACTGGGACCAACTGCCACAATACCAACTA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2071 AACAGACAGGATGCACCACATCTAGTAAAG         GGTGCCATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 111495 AACAGACAGGATGCACCACATCTAGTAAAGGTG...CAGGGTGCCATGGC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2112 AGCTACATATTCTGCTTTGAACCGTAATCAGTCACCAGTTTTGGAACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112124 AGCTACATATTCTGCTTTGAACCGTAATCAGTCACCAGTTTTGGAACCAG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2162 TAGGCCGCTCTACTCTTGCTCAGCGGAGAGGTATTAAAAAAATCACCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112174 TAGGCCGCTCTACTCTTGCTCAGCGGAGAGGTATTAAAAAAATCACCTCA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2212 ACAGCCCTGTGAAGTGACCTCAGTGAGATATTTGG ATCCATGGTGTAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||-|-|||||||||||-
 112224 ACAGCCCTGTGAAGTGACCTCAGTGAGATATTTGGTA CCATGGTGTAA