seq1 = /home/httpd/html/group-files/cgi-bin/cDNA_fasta.txt, 2506 bp
seq2 = /home/httpd/html/group-files/cgi-bin/DNA_fasta.txt (PRKCG_DNA), 26596 bp

>AF345987
>PRKCG_DNA

1-365  (1001-1365)   99% ->
366-397  (1864-1895)   100% ->
398-480  (2862-2944)   100% ->
481-592  (8339-8450)   98% ->
593-724  (8587-8718)   99% ->
725-881  (10375-10531)   100% ->
882-1016  (11210-11344)   100% ->
1017-1104  (11689-11776)   100% ->
1105-1134  (12063-12092)   100% ->
1135-1287  (16660-16812)   100% ->
1288-1476  (17141-17329)   100% ->
1477-1568  (18934-19025)   100% ->
1569-1631  (19120-19182)   100% ->
1632-1770  (19312-19450)   100% ->
1771-1851  (21774-21854)   100% ->
1852-1959  (23336-23443)   100% ->
1960-2100  (25018-25158)   100% ->
2101-2506  (25408-25813)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 CCTTGCGGAGCCGGCGCGCCCGGGGTGCCGCTCCCTGCCTGGCGCGCTCC
        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   1001 CCTGGCGGAGCCGGCGCGCCCGGGGTGCCGCTCCCTGCCTGGCGCGCTCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCACCTGGAGGTGCCTTGCCCCTCTCCTGCCCACCTCGGAATTTCCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   1051 GCACCTGGAGGTGCCTTGCCCCTCTCCTGCCCACCTCGGAATTTCCCTGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGCTCCTTTGATCCTTCGAGTCTCCAGCTCCTCTCCCTTCCACCTGTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   1101 GGCTCCTTTGATCCTTCGAGTCTCCAGCTCCTCTCCCTTCCACCTGTTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCCCAAGAAAGGCAGGATCCTGGTCCCTGCTACGTTTCTGGGGCCATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   1151 CCCCAAGAAAGGCAGGATCCTGGTCCCTGCTACGTTTCTGGGGCCATGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGGTCTGGGCCCCGGCGTAGGCGATTCAGAGGGGGGACCCCGGCCCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   1201 TGGTCTGGGCCCCGGCGTAGGCGATTCAGAGGGGGGACCCCGGCCCCTGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCTGCAGAAAGGGGGCTCTGAGGCAGAAGGTGGTCCACGAAGTCAAGAGC
        | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
   1251 TTTGCAGAAAGGGGGCCCTGAGGCAGAAGGTGGTCCACGAAGTCAAGAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CACAAGTTCACCGCTCGCTTCTTCAAGCAGCCCACCTTCTGCAGCCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   1301 CACAAGTTCACCGCTCGCTTCTTCAAGCAGCCCACCTTCTGCAGCCACTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CACCGACTTCATCTG         GGGTATCGGAAAGCAGGGCCTGCAAT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
   1351 CACCGACTTCATCTGGTG...CAGGGGTATCGGAAAGCAGGGCCTGCAAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GTCAAG         TCTGCAGCTTTGTGGTTCATCGACGATGCCACGAA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
   1890 GTCAAGGTA...TAGTCTGCAGCTTTGTGGTTCATCGACGATGCCACGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TTTGTGACCTTCGAGTGTCCAGGCGCTGGGAAGGGCCCCCAGACGGAC  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
   2897 TTTGTGACCTTCGAGTGTCCAGGCGCTGGGAAGGGCCCCCAGACGGACGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    481        GACCCCCGGAACAAACACAAGTTCCGCCTGCATAGCTACAGCA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   2947 G...CAGGACCCCCGGAACAAACACAAGTTCCGCCTGCATAGCTACAGCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GCCCCACCTTCTGCGACCACTGTGGCTCCCTCCTCTACGGGCTTGTGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   8382 GCCCCACCTTCTGCGACCACTGTGGCTCCCTCCTCTACGGGCTTGTGCAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 CAGGGCATGAAATGTTCTT         GCTGCGAGATGAACGTGCACCG
        |||||||||||||| || |>>>...>>>||||||||||||||||||||||
   8432 CAGGGCATGAAATGCTCCTGTG...CAGGCTGCGAGATGAACGTGCACCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GCGCTGTGTGCGTAGCGTGCCCTCTCTGTGCGGTGTGGACCACACCGAGC
        |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
   8609 GCGCTGTGTGCGTAGCGTGCCCTCCCTGTGCGGTGTGGACCACACCGAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GCCGCGGGCGCCTGCAGCTGGAGATCCGGGCTCCCACAGCAGATGAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   8659 GCCGCGGGCGCCTGCAGCTGGAGATCCGGGCTCCCACAGCAGATGAGATC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CACGTAACTG         TTGGCGAGGCCCGTAACCTAATTCCTATGGA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
   8709 CACGTAACTGGTG...TAGTTGGCGAGGCCCGTAACCTAATTCCTATGGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CCCCAATGGTCTCTCTGATCCCTATGTGAAACTGAAGCTCATCCCAGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  10406 CCCCAATGGTCTCTCTGATCCCTATGTGAAACTGAAGCTCATCCCAGACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 CTCGGAACCTGACGAAACAGAAGACCCGAACGGTGAAAGCCACGCTAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  10456 CTCGGAACCTGACGAAACAGAAGACCCGAACGGTGAAAGCCACGCTAAAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CCTGTGTGGAATGAGACCTTTGTGTT         CAACCTGAAGCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
  10506 CCTGTGTGGAATGAGACCTTTGTGTTGTG...CAGCAACCTGAAGCCAGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GGATGTGGAGCGCCGGCTCAGCGTGGAGGTGTGGGACTGGGACCGGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  11225 GGATGTGGAGCGCCGGCTCAGCGTGGAGGTGTGGGACTGGGACCGGACCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 CCCGCAACGACTTCATGGGGGCCATGTCCTTTGGCGTCTCGGAGCTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  11275 CCCGCAACGACTTCATGGGGGCCATGTCCTTTGGCGTCTCGGAGCTGCTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 AAGGCGCCCGTGGATGGCTG         GTACAAGTTACTGAACCAGGA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
  11325 AAGGCGCCCGTGGATGGCTGGTG...CAGGTACAAGTTACTGAACCAGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 GGAGGGCGAGTATTACAATGTGCCGGTGGCCGATGCTGACAACTGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  11710 GGAGGGCGAGTATTACAATGTGCCGGTGGCCGATGCTGACAACTGCAGCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 TCCTCCAGAAGTTTGAG         GCTTGTAACTACCCCCTGGAATTG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
  11760 TCCTCCAGAAGTTTGAGGTA...CAGGCTTGTAACTACCCCCTGGAATTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 TATGAG         CGGGTGCGGATGGGCCCCTCTTCCTCTCCCATCCC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
  12087 TATGAGGTG...CAGCGGGTGCGGATGGGCCCCTCTTCCTCTCCCATCCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 CTCCCCTTCCCCTAGTCCCACCGACCCCAAGCGCTGCTTCTTCGGGGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  16695 CTCCCCTTCCCCTAGTCCCACCGACCCCAAGCGCTGCTTCTTCGGGGCGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 GTCCAGGACGCCTGCACATCTCCGACTTCAGCTTCCTCATGGTTCTAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  16745 GTCCAGGACGCCTGCACATCTCCGACTTCAGCTTCCTCATGGTTCTAGGA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 AAAGGCAGTTTTGGGAAG         GTGATGCTGGCCGAGCGCAGGGG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
  16795 AAAGGCAGTTTTGGGAAGGTT...TAGGTGATGCTGGCCGAGCGCAGGGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 CTCTGATGAGCTCTACGCCATCAAGATCTTGAAAAAGGACGTGATCGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  17164 CTCTGATGAGCTCTACGCCATCAAGATCTTGAAAAAGGACGTGATCGTCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 AGGACGACGATGTGGACTGCACGCTGGTGGAGAAACGTGTGCTGGCGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  17214 AGGACGACGATGTGGACTGCACGCTGGTGGAGAAACGTGTGCTGGCGCTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 GGGGGCCGGGGTCCTGGCGGCCGGCCCCACTTCCTCACCCAGCTCCACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  17264 GGGGGCCGGGGTCCTGGCGGCCGGCCCCACTTCCTCACCCAGCTCCACTC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 CACCTTCCAGACCCCG         GACCGCCTGTATTTCGTGATGGAGT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
  17314 CACCTTCCAGACCCCGGTA...CAGGACCGCCTGTATTTCGTGATGGAGT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 ACGTCACCGGGGGAGACTTGATGTACCACATTCAACAGCTGGGCAAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  18959 ACGTCACCGGGGGAGACTTGATGTACCACATTCAACAGCTGGGCAAGTTT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 AAGGAGCCCCATGCAGC         GTTCTACGCGGCAGAAATCGCTAT
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
  19009 AAGGAGCCCCATGCAGCGTG...CAGGTTCTACGCGGCAGAAATCGCTAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 CGGCCTCTTCTTCCTTCACAATCAGGGCATCATCTACAG         GG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
  19144 CGGCCTCTTCTTCCTTCACAATCAGGGCATCATCTACAGGTG...CAGGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 ACCTGAAGCTGGACAATGTGATGCTGGATGCTGAGGGACACATCAAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  19314 ACCTGAAGCTGGACAATGTGATGCTGGATGCTGAGGGACACATCAAGATC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 ACTGACTTTGGCATGTGTAAGGAGAACGTCTTCCCCGGGACGACAACCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  19364 ACTGACTTTGGCATGTGTAAGGAGAACGTCTTCCCCGGGACGACAACCCG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 CACCTTCTGCGGGACCCCGGACTACATAGCCCCGGAG         ATCA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
  19414 CACCTTCTGCGGGACCCCGGACTACATAGCCCCGGAGGTA...TAGATCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 TTGCCTACCAGCCCTATGGGAAGTCTGTCGATTGGTGGTCCTTTGGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  21778 TTGCCTACCAGCCCTATGGGAAGTCTGTCGATTGGTGGTCCTTTGGAGTT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1825 CTGCTGTATGAGATGTTGGCAGGACAG         CCTCCCTTCGATGG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
  21828 CTGCTGTATGAGATGTTGGCAGGACAGGTA...TAGCCTCCCTTCGATGG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1866 GGAGGACGAGGAGGAGCTGTTTCAGGCCATCATGGAACAAACTGTCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  23350 GGAGGACGAGGAGGAGCTGTTTCAGGCCATCATGGAACAAACTGTCACCT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1916 ACCCCAAGTCGCTTTCCCGGGAAGCCGTGGCCATCTGCAAGGGG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
  23400 ACCCCAAGTCGCTTTCCCGGGAAGCCGTGGCCATCTGCAAGGGGGTG...

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1960    TTCCTGACCAAGCACCCAGGGAAGCGCCTGGGCTCAGGGCCTGATGG
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  25015 CAGTTCCTGACCAAGCACCCAGGGAAGCGCCTGGGCTCAGGGCCTGATGG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2007 GGAACCTACCATCCGTGCACATGGCTTTTTCCGCTGGATTGACTGGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  25065 GGAACCTACCATCCGTGCACATGGCTTTTTCCGCTGGATTGACTGGGAGC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2057 GGCTGGAACGATTGGAGATCCCGCCTCCTTTCAGACCCCGCCCG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
  25115 GGCTGGAACGATTGGAGATCCCGCCTCCTTTCAGACCCCGCCCGGTC...

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2101    TGTGGCCGCAGCGGCGAGAACTTTGACAAGTTCTTCACGCGGGCGGC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  25405 CAGTGTGGCCGCAGCGGCGAGAACTTTGACAAGTTCTTCACGCGGGCGGC

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2148 GCCAGCGCTGACCCCTCCAGACCGCCTAGTCCTGGCCAGCATCGACCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  25455 GCCAGCGCTGACCCCTCCAGACCGCCTAGTCCTGGCCAGCATCGACCAGG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2198 CCGATTTCCAGGGCTTCACCTACGTGAACCCCGACTTCGTGCACCCGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  25505 CCGATTTCCAGGGCTTCACCTACGTGAACCCCGACTTCGTGCACCCGGAT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2248 GCCCGCAGCCCCACCAGCCCAGTGCCTGTGCCCGTCATGTAATCTCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  25555 GCCCGCAGCCCCACCAGCCCAGTGCCTGTGCCCGTCATGTAATCTCACCC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2298 GCCGCCACTAGGTGTCCCCAACGTCCCCTCCGCCGTGCCGGCGGCAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  25605 GCCGCCACTAGGTGTCCCCAACGTCCCCTCCGCCGTGCCGGCGGCAGCCC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2348 CACTTCACCCCCAACTTCACCACCCCCTGTCCCATTCTAGATCCTGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  25655 CACTTCACCCCCAACTTCACCACCCCCTGTCCCATTCTAGATCCTGCACC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2398 CCAGCATTCCAGCTCTGCCCCCGCGGGTTCTAGACGCCCCTCCCAAGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  25705 CCAGCATTCCAGCTCTGCCCCCGCGGGTTCTAGACGCCCCTCCCAAGCGT

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2448 TCCTGGCCTTCTGAACTCCATACAGCCTCTACAGCCGTCCCGCGTTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  25755 TCCTGGCCTTCTGAACTCCATACAGCCTCTACAGCCGTCCCGCGTTCAAG

   2650     .
   2498 ACTTGAGCG
        |||||||||
  25805 ACTTGAGCG