seq1 = /home/httpd/html/group-files/cgi-bin/cDNA_fasta.txt, 1863 bp
seq2 = /home/httpd/html/group-files/cgi-bin/DNA_fasta.txt (PRKAA1_DNA), 40803 bp

>AB022017
>PRKAA1_DNA

1-123  (993-1115)   100% ->
124-265  (21592-21733)   100% ->
266-359  (23675-23768)   100% ->
360-504  (27315-27459)   100% ->
505-592  (29675-29762)   100% ->
593-817  (31488-31712)   99% ->
818-1304  (33940-34427)   99% ->
1305-1431  (34539-34665)   100% ->
1432-1863  (36157-36588)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 GCAGACTCAGTTCCTGGAGAAAGATGGCGACAGCCGAGAAGCAGAAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    993 GCAGACTCAGTTCCTGGAGAAAGATGGCGACAGCCGAGAAGCAGAAACAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GACGGGCGGGTGAAGATCGGCCACTACATTCTGGGTGACACGCTGGGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   1043 GACGGGCGGGTGAAGATCGGCCACTACATTCTGGGTGACACGCTGGGGGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGGCACCTTCGGCAAAGTGAAGG         TTGGCAAACATGAATTGA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
   1093 CGGCACCTTCGGCAAAGTGAAGGGTG...CAGTTGGCAAACATGAATTGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTGGGCATAAAGTAGCTGTGAAGATACTCAATCGACAGAAGATTCGGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  21610 CTGGGCATAAAGTAGCTGTGAAGATACTCAATCGACAGAAGATTCGGAGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTTGATGTGGTAGGAAAAATCCGCAGAGAAATTCAGAACCTCAAGCTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  21660 CTTGATGTGGTAGGAAAAATCCGCAGAGAAATTCAGAACCTCAAGCTTTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CAGGCATCCTCATATAATTAAACT         GTACCAGGTCATCAGTA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
  21710 CAGGCATCCTCATATAATTAAACTGTA...CAGGTACCAGGTCATCAGTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CACCATCTGATATTTTCATGGTGATGGAATATGTCTCAGGAGGAGAGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  23692 CACCATCTGATATTTTCATGGTGATGGAATATGTCTCAGGAGGAGAGCTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TTTGATTATATCTGTAAGAATGGAAGG         CTGGATGAAAAAGA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
  23742 TTTGATTATATCTGTAAGAATGGAAGGGTA...TAGCTGGATGAAAAAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AAGTCGGCGTCTGTTCCAACAGATCCTTTCTGGTGTGGATTATTGTCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  27329 AAGTCGGCGTCTGTTCCAACAGATCCTTTCTGGTGTGGATTATTGTCACA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GGCATATGGTGGTCCATAGAGATTTGAAACCTGAAAATGTCCTGCTTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  27379 GGCATATGGTGGTCCATAGAGATTTGAAACCTGAAAATGTCCTGCTTGAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GCACACATGAATGCAAAGATAGCTGATTTTG         GTCTTTCAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
  27429 GCACACATGAATGCAAAGATAGCTGATTTTGGTA...CAGGTCTTTCAAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CATGATGTCAGATGGTGAATTTTTAAGAACAAGTTGTGGCTCACCCAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  29685 CATGATGTCAGATGGTGAATTTTTAAGAACAAGTTGTGGCTCACCCAACT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ATGCTGCACCAGAAGTAATTTCAGGAAG         ATTGTATGCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
  29735 ATGCTGCACCAGAAGTAATTTCAGGAAGGTA...CAGATTGTATGCAGGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CCAGAGGTAGATATATGGAGCAGTGGGGTTATTCTCTATGCTTTATTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  31501 CCAGAGGTAGATATATGGAGCAGTGGGGTTATTCTCTATGCTTTATTATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TGGAACCCTTCCATTTGATGATGACCATGTGCCAACTCTTTTTAAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  31551 TGGAACCCTTCCATTTGATGATGACCATGTGCCAACTCTTTTTAAGAAGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TATGTGATGGGATCTTCTATACCCCTCAATATTTAAATCCTTCTGTGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  31601 TATGTGATGGGATCTTCTATACCCCTCAATATTTAAATCCTTCTGTGATT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 AGCCTTTTGAAACATATGCTGCAGGTGGATCCCATGAAGAGGGCCTCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
  31651 AGCCTTTTGAAACATATGCTGCAGGTGGATCCCATGAAGAGGGCCACAAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 CAAAGATATCAG         GGAACATGAATGGTTTAAACAGGACCTTC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
  31701 CAAAGATATCAGGTA...CAGGGAACATGAATGGTTTAAACAGGACCTTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CAAAATATCTCTTTCCTGAGGATCCATCATATAGTTCAACCATGATTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  33969 CAAAATATCTCTTTCCTGAGGATCCATCATATAGTTCAACCATGATTGAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 GATGAAGCCTTAAAAGAAGTATGT GAAAAGTTTGAGTGCTCAGAAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||
  34019 GATGAAGCCTTAAAAGAAGTATGTCGAAAAGTTTGAGTGCTCAGAAGAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    946 AAGTTCTCAGCTGTCTTTACAACAGAAATCACCAGGATCCTTTGGCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  34069 AAGTTCTCAGCTGTCTTTACAACAGAAATCACCAGGATCCTTTGGCAGTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    996 GCCTACCATCTCATAATAGATAACAGGAGAATAATGAATGAAGCCAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  34119 GCCTACCATCTCATAATAGATAACAGGAGAATAATGAATGAAGCCAAAGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1046 TTTCTATTTGGCGACAAGCCCACCTGATTCTTTTCTTGATGATCATCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  34169 TTTCTATTTGGCGACAAGCCCACCTGATTCTTTTCTTGATGATCATCACC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1096 TGACTCGGCCCCATCCTGAAAGAGTACCATTCTTGGTTGCTGAAACACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  34219 TGACTCGGCCCCATCCTGAAAGAGTACCATTCTTGGTTGCTGAAACACCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1146 AGGGCACGCCATACCCTTGATGAATTAAATCCACAGAAATCCAAACACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  34269 AGGGCACGCCATACCCTTGATGAATTAAATCCACAGAAATCCAAACACCA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1196 AGGTGTAAGGAAAGCAAAATGGCATTTAGGAATTAGAAGTCAAAGTCGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  34319 AGGTGTAAGGAAAGCAAAATGGCATTTAGGAATTAGAAGTCAAAGTCGAC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1246 CAAATGATATTATGGCAGAAGTATGTAGAGCAATCAAACAATTGGATTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  34369 CAAATGATATTATGGCAGAAGTATGTAGAGCAATCAAACAATTGGATTAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1296 GAATGGAAG         GTTGTAAACCCATATTATTTGCGTGTACGAAG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
  34419 GAATGGAAGGTA...TAGGTTGTAAACCCATATTATTTGCGTGTACGAAG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1337 GAAGAATCCTGTGACAAGCACTTACTCCAAAATGAGTCTACAGTTATACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  34571 GAAGAATCCTGTGACAAGCACTTACTCCAAAATGAGTCTACAGTTATACC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1387 AAGTGGATAGTAGAACTTATCTACTGGATTTCCGTAGTATTGATG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
  34621 AAGTGGATAGTAGAACTTATCTACTGGATTTCCGTAGTATTGATGGTA..

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1432     ATGAAATTACAGAAGCCAAATCAGGGACTGCTACTCCACAGAGATC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  34671 .CAGATGAAATTACAGAAGCCAAATCAGGGACTGCTACTCCACAGAGATC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1478 GGGATCAGTTAGCAACTATCGATCTTGCCAAAGGAGTGATTCAGATGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  36203 GGGATCAGTTAGCAACTATCGATCTTGCCAAAGGAGTGATTCAGATGCTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1528 AGGCTCAAGGAAAATCCTCAGAAGTTTCTCTTACCTCATCTGTGACCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  36253 AGGCTCAAGGAAAATCCTCAGAAGTTTCTCTTACCTCATCTGTGACCTCA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1578 CTTGACTCTTCTCCTGTTGACCTAACTCCAAGACCTGGAAGTCACACAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  36303 CTTGACTCTTCTCCTGTTGACCTAACTCCAAGACCTGGAAGTCACACAAT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1628 AGAATTTTTTGAGATGTGTGCAAATCTAATTAAAATTCTTGCACAATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  36353 AGAATTTTTTGAGATGTGTGCAAATCTAATTAAAATTCTTGCACAATAAA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1678 CAGAAAACTTTGCTTATTTCTTTTGCAGCAATAAGCATGCATAATAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  36403 CAGAAAACTTTGCTTATTTCTTTTGCAGCAATAAGCATGCATAATAAGTC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1728 ACAGCCAAATGCTTCCATTTGTAATCAAGTTATACATAATTATAACCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  36453 ACAGCCAAATGCTTCCATTTGTAATCAAGTTATACATAATTATAACCGAG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1778 GGCTGGCGTTTTGGAAT CGAATTT CGACAGGGATTGGAACATGATTTA
        |||||||||||||||||-|-|||||-|-||||||||||||||||||||||
  36503 GGCTGGCGTTTTGGAATGC AATTTGC ACAGGGATTGGAACATGATTTA

   1900     .    :    .    :    .    :    .
   1826 TAGTTAAAAGCCTAATAT CGAGAAATGAATTAAGATCA
        ||||||||||||||||||-|-||||||||||||||||||
  36551 TAGTTAAAAGCCTAATATGC AGAAATGAATTAAGATCA