seq1 = /home/httpd/html/group-files/cgi-bin/cDNA_fasta.txt, 3608 bp
seq2 = /home/httpd/html/group-files/cgi-bin/DNA_fasta.txt (MERTK_DNA), 132129 bp

>U08023
>MERTK_DNA

6-198  (868-1061)   96% ->
199-619  (31385-31805)   99% ->
620-720  (47225-47325)   100% ->
721-894  (49659-49832)   98% ->
895-981  (67456-67542)   98% ->
982-1097  (70402-70517)   100% ->
1098-1281  (77554-77737)   98% ->
1282-1433  (85107-85258)   100% ->
1434-1587  (96516-96669)   100% ->
1588-1741  (99588-99741)   100% ->
1742-1827  (103466-103551)   100% ->
1828-1923  (105357-105452)   100% ->
1924-2004  (106169-106249)   100% ->
2005-2097  (110648-110740)   98% ->
2098-2216  (112213-112331)   100% ->
2217-2326  (121678-121787)   100% ->
2327-2486  (123687-123846)   100% ->
2487-2623  (124523-124659)   98% ->
2624-3565  (130616-131558)   99% ->
3566-3608  (131589-131631)   91%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      6 CGTGTCTCGGCACTCACT CCC GGCCGCCCGGACAGGGAGCTTTCGCTG
        ||   |||||||||||||-|||-|||||||||||||||||||||-|||||
    868 CGCCACTCGGCACTCACTGCCCGGGCCGCCCGGACAGGGAGCTT CGCTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     54 GCGCGCTTGGCCGGCGACAGGACAGGTTCGGGACGTCCATCTGTCCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    917 GCGCGCTTGGCCGGCGACAGGACAGGTTCGGGACGTCCATCTGTCCATCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    104 GTCCGGAGAGAAATTACAGATCCGCAGCCCCGGGATGGGGCCGGCCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    967 GTCCGGAGAGAAATTACAGATCCGCAGCCCCGGGATGGGGCCGGCCCCGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    154 TGCCGCTGCTGCTGGGCCTCTTCCTCCCCGCGCTCTGGCGTAGAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
   1017 TGCCGCTGCTGCTGGGCCTCTTCCTCCCCGCGCTCTGGCGTAGAGGTG..

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    199     CTATCACTGAGGCAAGGGAAGAAGCCAAGCCTTACCCGCTATTCCC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   1067 .CAGCTATCACTGAGGCAAGGGAAGAAGCCAAGCCTTACCCGCTATTCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    245 GGGACCTTTTCCAGGGAGCCTGCAAACTGACCACACACCGCTGTTATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  31431 GGGACCTTTTCCAGGGAGCCTGCAAACTGACCACACACCGCTGTTATCCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    295 TTCCTCACGCCAGTGGGTACCAGCCTGCCTTGATGTTTTCACCAACCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  31481 TTCCTCACGCCAGTGGGTACCAGCCTGCCTTGATGTTTTCACCAACCCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    345 CCTGGAAGACCACATACAGGAAACGTAGCCATTCCCCAGGTGACCTCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  31531 CCTGGAAGACCACATACAGGAAACGTAGCCATTCCCCAGGTGACCTCTGT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    395 CGAATCAAAGCCCCTACCGCCTCTTGCCTTCAAACACACAGTTGGACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  31581 CGAATCAAAGCCCCTACCGCCTCTTGCCTTCAAACACACAGTTGGACACA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    445 TAATACTTTCTGAACATAAAGGTGTCAAATTTAATTGCTCAATCAATGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
  31631 TAATACTTTCTGAACATAAAGGTGTCAAATTTAATTGCTCAATCAGTGTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    495 CCTAATATATACCAGGACACCACAATTTCTTGGTGGAAAGATGGGAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  31681 CCTAATATATACCAGGACACCACAATTTCTTGGTGGAAAGATGGGAAGGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    545 ATTGCTTGGGGGACATCAT CGAATTACACAGTTTTATCCAGATGATGAA
        ||||||||||| |||||||-|-||||||||||||||||||||||||||||
  31731 ATTGCTTGGGGCACATCATGC AATTACACAGTTTTATCCAGATGATGAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    594 GTTACAGCAATAATCGCTTCCTTCAG         CATAACCAGTGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
  31780 GTTACAGCAATAATCGCTTCCTTCAGGTA...CAGCATAACCAGTGTGCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    635 GCGTTCAGACAATGGGTCGTATATCTGTAAGATGAAAATAAACAATGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  47240 GCGTTCAGACAATGGGTCGTATATCTGTAAGATGAAAATAAACAATGAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    685 AGATCGTGTCTGATCCCATCTACATCGAAGTACAAG         GACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
  47290 AGATCGTGTCTGATCCCATCTACATCGAAGTACAAGGTA...CAGGACTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    726 CCTCACTTTACTAAGCAGCCTGAGAGCATGAATGTCACCAGAAACACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  49664 CCTCACTTTACTAAGCAGCCTGAGAGCATGAATGTCACCAGAAACACAGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    776 CTTCAACCTCACCTGTCAGGCTGTGGGCCCGCCTGAGCCCGTCAACATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  49714 CTTCAACCTCACCTGTCAGGCTGTGGGCCCGCCTGAGCCCGTCAACATTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    826 TCTGGGTTCAAAACAGTAGCCGTGTTAACGAACAGCCTGAAAAATCCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  49764 TCTGGGTTCAAAACAGTAGCCGTGTTAACGAACAGCCTGAAAAATCCCCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    876 GGCGTGCTAACTGTTCCAG         GCCTGACGGAGATGGCGGTCTT
          |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
  49814 TCCGTGCTAACTGTTCCAGGTA...CAGGCCTGACGGAGATGGCGGTCTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    917 CAGTTGTGAGGCCCACAATGACAAAGGGCTGACCGTGTCCCAGGGAGTGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
  67478 CAGTTGTGAGGCCCACAATGACAAAGGGCTGACCGTGTCCAAGGGAGTGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    967 AGATCAACATCAAAG         CAATTCCCTCCCCACCAACTGAAGTC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
  67528 AGATCAACATCAAAGGTA...CAGCAATTCCCTCCCCACCAACTGAAGTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1008 AGCATCCGTAACAGCACTGCACACAGCATTCTGATCTCCTGGGTTCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  70428 AGCATCCGTAACAGCACTGCACACAGCATTCTGATCTCCTGGGTTCCTGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1058 TTTTGATGGATACTCCCCGTTCAGGAATTGCAGCATTCAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
  70478 TTTTGATGGATACTCCCCGTTCAGGAATTGCAGCATTCAGGTA...TAGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1099 TCAAGGAAGCTGATCCGCTGGGTAATGGCTCAGTCATGATTTTTAACACC
        |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
  77555 TCAAGGAAGCTGATCCGCTGAGTAATGGCTCAGTCATGATTTTTAACACC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1149 TCTGCCTTACCACATCTGTACCAAATCAAGCAGCTGCAAGCCCTGGCTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  77605 TCTGCCTTACCACATCTGTACCAAATCAAGCAGCTGCAAGCCCTGGCTAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1199 TTACAGCATTGGTGTTTCCTGCATGAATGAAATAGGCTGGTCTGCAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  77655 TTACAGCATTGGTGTTTCCTGCATGAATGAAATAGGCTGGTCTGCAGTGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1249 GCCCTTGGATTCTAGCAAGCACGACTGAAGGAG         CCCCATCA
        |||||||||||||||| ||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
  77705 GCCCTTGGATTCTAGCCAGCACGACTGAAGGAGGTA...TAGCCCCATCA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1290 GTAGCACCTTTAAATGTCACTGTGTTTCTGAATGAATCTAGTGATAATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  85115 GTAGCACCTTTAAATGTCACTGTGTTTCTGAATGAATCTAGTGATAATGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1340 GGACATCAGATGGATGAAGCCTCCGACTAAGCAGCAGGATGGAGAACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  85165 GGACATCAGATGGATGAAGCCTCCGACTAAGCAGCAGGATGGAGAACTGG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1390 TGGGCTACCGGATATCCCACGTGTGGCAGAGTGCAGGGATTTCC      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
  85215 TGGGCTACCGGATATCCCACGTGTGGCAGAGTGCAGGGATTTCCGTA...

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1434    AAAGAGCTCTTGGAGGAAGTTGGCCAGAATGGCAGCCGAGCTCGGAT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  96513 CAGAAAGAGCTCTTGGAGGAAGTTGGCCAGAATGGCAGCCGAGCTCGGAT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1481 CTCTGTTCAAGTCCACAATGCTACGTGCACAGTGAGGATTGCAGCCGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  96563 CTCTGTTCAAGTCCACAATGCTACGTGCACAGTGAGGATTGCAGCCGTCA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1531 CCAGAGGGGGAGTTGGGCCCTTCAGTGATCCAGTGAAAATATTTATCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  96613 CCAGAGGGGGAGTTGGGCCCTTCAGTGATCCAGTGAAAATATTTATCCCT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1581 GCACACG         GTTGGGTAGATTATGCCCCCTCTTCAACTCCGGC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
  96663 GCACACGGTG...CAGGTTGGGTAGATTATGCCCCCTCTTCAACTCCGGC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1622 GCCTGGCAACGCAGATCCTGTGCTCATCATCTTTGGCTGCTTTTGTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99622 GCCTGGCAACGCAGATCCTGTGCTCATCATCTTTGGCTGCTTTTGTGGAT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1672 TTATTTTGATTGGGTTGATTTTATACATCTCCTTGGCCATCAGAAAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99672 TTATTTTGATTGGGTTGATTTTATACATCTCCTTGGCCATCAGAAAAAGA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1722 GTCCAGGAGACAAAGTTTGG         GAATGCATTCACAGAGGAGGA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
  99722 GTCCAGGAGACAAAGTTTGGGTA...CAGGAATGCATTCACAGAGGAGGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1763 TTCTGAATTAGTGGTGAATTATATAGCAAAGAAATCCTTCTGTCGGCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103487 TTCTGAATTAGTGGTGAATTATATAGCAAAGAAATCCTTCTGTCGGCGAG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1813 CCATTGAACTTACCT         TACATAGCTTGGGAGTCAGTGAGGAA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 103537 CCATTGAACTTACCTGTA...CAGTACATAGCTTGGGAGTCAGTGAGGAA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1854 CTACAAAATAAACTAGAAGATGTTGTGATTGACAGGAATCTTCTAATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105383 CTACAAAATAAACTAGAAGATGTTGTGATTGACAGGAATCTTCTAATTCT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1904 TGGAAAAATTCTGGGTGAAG         GAGAGTTTGGGTCTGTAATGG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 105433 TGGAAAAATTCTGGGTGAAGGTA...CAGGAGAGTTTGGGTCTGTAATGG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1945 AAGGAAATCTTAAGCAGGAAGATGGGACCTCTCTGAAAGTGGCAGTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106190 AAGGAAATCTTAAGCAGGAAGATGGGACCTCTCTGAAAGTGGCAGTGAAG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1995 ACCATGAAGT         TGGACAACTCTTCACATCGGGAGATCGAGGA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||| ||||||||||||||
 106240 ACCATGAAGTGTG...TAGTGGACAACTCTTCACAGCGGGAGATCGAGGA

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2036 GTTTCTCAGTGAGGCAGCGTGCATGAAAGACTTCAGCCACCCAAATGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110679 GTTTCTCAGTGAGGCAGCGTGCATGAAAGACTTCAGCCACCCAAATGTCA

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2086 TTCGACTTCTAG         GTGTGTGTATAGAAATGAGCTCTCAAGGC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 110729 TTCGACTTCTAGGTA...CAGGTGTGTGTATAGAAATGAGCTCTCAAGGC

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2127 ATCCCAAAGCCCATGGTAATTTTACCCTTCATGAAATACGGGGACCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112242 ATCCCAAAGCCCATGGTAATTTTACCCTTCATGAAATACGGGGACCTGCA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2177 TACTTACTTACTTTATTCCCGATTGGAGACAGGACCAAAG         C
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 112292 TACTTACTTACTTTATTCCCGATTGGAGACAGGACCAAAGGTA...TAGC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2218 ATATTCCTCTGCAGACACTATTGAAGTTCATGGTGGATATTGCCCTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121679 ATATTCCTCTGCAGACACTATTGAAGTTCATGGTGGATATTGCCCTGGGA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2268 ATGGAGTATCTGAGCAACAGGAATTTTCTTCATCGAGATTTAGCTGCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121729 ATGGAGTATCTGAGCAACAGGAATTTTCTTCATCGAGATTTAGCTGCTCG

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2318 AAACTGCAT         GTTGCGAGATGACATGACTGTCTGTGTTGCGG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 121779 AAACTGCATGTA...TAGGTTGCGAGATGACATGACTGTCTGTGTTGCGG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2359 ACTTCGGCCTCTCTAAGAAGATTTACAGTGGCGATTATTACCGCCAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123719 ACTTCGGCCTCTCTAAGAAGATTTACAGTGGCGATTATTACCGCCAAGGC

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2409 CGCATTGCTAAGATGCCTGTTAAATGGATCGCCATAGAAAGTCTTGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123769 CGCATTGCTAAGATGCCTGTTAAATGGATCGCCATAGAAAGTCTTGCAGA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2459 CCGAGTCTACACAAGTAAAAGTGATGTG         TGGGCATTTGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 123819 CCGAGTCTACACAAGTAAAAGTGATGTGGTA...CAGTGGGCATTTGGCG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2500 TGACCATGTGGGAAATA CGTACGCGGGGAATGACTCCCTATCCTGGGGT
        |||||||||||||||||-|-||||||||||||||||||||||||||||||
 124536 TGACCATGTGGGAAATAGC TACGCGGGGAATGACTCCCTATCCTGGGGT

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2549 CCAGAACCATGAGATGTATGACTATCTTCTCCATGGCCACAGGTTGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124585 CCAGAACCATGAGATGTATGACTATCTTCTCCATGGCCACAGGTTGAAGC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2599 AGCCCGAAGACTGCCTGGATGAACT         GTATGAAATAATGTAC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 124635 AGCCCGAAGACTGCCTGGATGAACTGTG...CAGGTATGAAATAATGTAC

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2640 TCTTGCTGGAGAACCGATCCCTTAGACCGCCCCACCTTTTCAGTATTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130632 TCTTGCTGGAGAACCGATCCCTTAGACCGCCCCACCTTTTCAGTATTGAG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2690 GCTGCAGCTAGAAAAACTCTTAGAAAGTTTGCCTGACGTTCGGAACCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130682 GCTGCAGCTAGAAAAACTCTTAGAAAGTTTGCCTGACGTTCGGAACCAAG

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2740 CAGACGTTATTTACGTCAATACACAGTTGCTGGAGAGCTCTGAGGGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130732 CAGACGTTATTTACGTCAATACACAGTTGCTGGAGAGCTCTGAGGGCCTG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2790 GCCCAGGGCCCCACCCTTGCTCCACTGGACTTGAACATCGACCCTGACTC
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130782 GCCCAGGGCTCCACCCTTGCTCCACTGGACTTGAACATCGACCCTGACTC

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2840 TATAATTGCCTCCTGCACTCCCCGCGCTGCCATCAGTGTGGTCACAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130832 TATAATTGCCTCCTGCACTCCCCGCGCTGCCATCAGTGTGGTCACAGCAG

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2890 AAGTTCATGACAGCAAACCTCATGAAGGACGGTACATCCTGAATGGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130882 AAGTTCATGACAGCAAACCTCATGAAGGACGGTACATCCTGAATGGGGGC

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2940 AGTGAGGAATGGGAAGATCTGACTTCTGCCCCCTCTGCTGCAGTCACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130932 AGTGAGGAATGGGAAGATCTGACTTCTGCCCCCTCTGCTGCAGTCACAGC

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2990 TGAAAAGAACAGTGTTTTACCGGGGGAGAGACTTGTTAGGAATGGGGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130982 TGAAAAGAACAGTGTTTTACCGGGGGAGAGACTTGTTAGGAATGGGGTCT

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3040 CCTGGTCCCATTCGAGCATGCTGCCCTTGGGAAGCTCATTGCCCGATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131032 CCTGGTCCCATTCGAGCATGCTGCCCTTGGGAAGCTCATTGCCCGATGAA

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3090 CTTTTGTTTGCTGACGACTCCTCAGAAGGCTCAGAAGTCCTGATGTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131082 CTTTTGTTTGCTGACGACTCCTCAGAAGGCTCAGAAGTCCTGATGTGAGG

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3140 AGAGGTGCGGGGAGACATTCCAAAAATCAAGCCAATTCTTCTGCTGTAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131132 AGAGGTGCGGGGAGACATTCCAAAAATCAAGCCAATTCTTCTGCTGTAGG

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3190 AGAATCCAATTGTACCTGATGTTTTTGGTATTTGTCTTCCTTACCAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131182 AGAATCCAATTGTACCTGATGTTTTTGGTATTTGTCTTCCTTACCAAGTG

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3240 AACTCCATGGCCCCAAAGCACCAGATGAATGTTGTTAAGGAAGCTGTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
 131232 AACTCCATGGCCCCAAAGCACCAGATGAATGTTGTTAAGTAAGCTGTCAT

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3290 TAAAAATACATAATATATATTTATTTAAAGAGAAAAAATATGTGTATATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131282 TAAAAATACATAATATATATTTATTTAAAGAGAAAAAATATGTGTATATC

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3340 ATG AAAAAGACAAGGATATTTTAATAAAACATTACTTATTTCATTTCAC
        |||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131332 ATGGAAAAAGACAAGGATATTTTAATAAAACATTACTTATTTCATTTCAC

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3389 TTATCTTGCATATCTTAAAATTAAGCTTCAGCTGCTCCTTGATATTAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
 131382 TTATCTTGCATATCTTAAAATTAAGCTTCAGCTGCTCCTTGATATTAACA

   3600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3439 TTTGTACAGAGTTGAAGTTGTTTTTTCAACTTCTTTTCTTTTTCATTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||
 131432 TTTGTACAGAGTTGAAGTTGTTTTTTCAAGTTCTTTTCTTTTTCATGACT

   3650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3489 ATTAAATGTAAAAATATTTGTAAAATGAAATGCCATATTTGACTTGGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131482 ATTAAATGTAAAAATATTTGTAAAATGAAATGCCATATTTGACTTGGCTT

   3700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3539 CTGGTCTTGATGTATTTGATAAGAATG         ATTAATTTTCTGAT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 131532 CTGGTCTTGATGTATTTGATAAGAATGATT...CTGATTAATTTTCTGAT

   3750     .    :    .    :    .    :
   3580 ATGGCTTCCATAATAAAAT TGAA ATAGGA
        |||||||||-|||||||||-||||-|-||||
 131603 ATGGCTTCC TAATAAAATATGAATA AGGA