seq1 = /home/httpd/html/group-files/cgi-bin/cDNA_fasta.txt, 4064 bp
seq2 = /home/httpd/html/group-files/cgi-bin/DNA_fasta.txt (JAK3_DNA), 23575 bp

>U09607
>JAK3_DNA

1-41  (4519-4559)   100% ==
81-279  (4560-4758)   99% ->
280-403  (5092-5215)   100% ->
404-515  (5501-5612)   100% ->
516-661  (5820-5965)   100% ->
662-956  (6382-6676)   98% ->
957-1079  (7230-7352)   100% ->
1080-1237  (7446-7603)   100% ->
1238-1349  (8651-8762)   100% ->
1350-1536  (9329-9515)   100% ->
1537-1664  (10602-10729)   100% ->
1665-1796  (10929-11060)   100% ->
1797-1881  (11779-11863)   100% ->
1882-2009  (12941-13068)   100% ->
2010-2142  (13777-13909)   100% ->
2143-2294  (13989-14140)   100% ->
2295-2445  (14271-14421)   100% ->
2446-2585  (16063-16202)   100% ->
2586-2775  (16284-16473)   98% ->
2776-2900  (17194-17318)   98% ->
2901-3073  (17592-17764)   100% ->
3074-3191  (18372-18489)   100% ->
3192-3302  (18774-18884)   100% ->
3303-4064  (22082-22840)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :
      1 CCCTCTGACCAGGACTGAGGGGCTTTTTCTCTCTGTGCCCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   4519 CCCTCTGACCAGGACTGAGGGGCTTTTTCTCTCTGTGCCCC

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     81 AGGCAAGTTGCACTCATGGCACCTCCAAGTGAAGAGACGCCCCTGATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   4560 AGGCAAGTTGCACTCATGGCACCTCCAAGTGAAGAGACGCCCCTGATCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    131 TCAGCGTTCATGCAGCCTCTTGTCCACGGAGGCTGGTGCCCTGCATGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   4610 TCAGCGTTCATGCAGCCTCTTGTCCACGGAGGCTGGTGCCCTGCATGTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    181 TGCTGCCCGCTCGGG CCCCGGGGCCCCCCCAGCGCCTATCTTTCTCCTT
        |||||||||||||||-|||||||-||||||||||||||||||||||||||
   4660 TGCTGCCCGCTCGGGGCCCCGGG CCCCCCCAGCGCCTATCTTTCTCCTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    230 TGGGGACCACTTGGCTGAGGACCTGTGCGTGCAGGCTGCCAAGGCCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   4709 TGGGGACCACTTGGCTGAGGACCTGTGCGTGCAGGCTGCCAAGGCCAGCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    280          GCATCCTGCCTGTGTACCACTCCCTCTTTGCTCTGGCCACG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   4759 GTG...TAGGCATCCTGCCTGTGTACCACTCCCTCTTTGCTCTGGCCACG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    321 GAGGACCTGTCCTGCTGGTTCCCCCCGAGCCACATCTTCTCCGTGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   5133 GAGGACCTGTCCTGCTGGTTCCCCCCGAGCCACATCTTCTCCGTGGAGGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    371 TGCCAGCACCCAAGTCCTGCTGTACAGGATTCG         CTTTTACT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
   5183 TGCCAGCACCCAAGTCCTGCTGTACAGGATTCGGTA...CAGCTTTTACT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    412 TCCCCAATTGGTTTGGGCTGGAGAAGTGCCACCGCTTCGGGCTACGCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   5509 TCCCCAATTGGTTTGGGCTGGAGAAGTGCCACCGCTTCGGGCTACGCAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    462 GATTTGGCCAGTGCTATCCTTGACCTGCCAGTCCTGGAGCACCTCTTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   5559 GATTTGGCCAGTGCTATCCTTGACCTGCCAGTCCTGGAGCACCTCTTTGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    512 CCAG         CACCGCAGTGACCTGGTGAGTGGGCGCCTCCCCGTGG
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   5609 CCAGGTG...CAGCACCGCAGTGACCTGGTGAGTGGGCGCCTCCCCGTGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    553 GCCTCAGTCTCAAGGAGCAGGGTGAGTGTCTCAGCCTGGCCGTGTTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   5857 GCCTCAGTCTCAAGGAGCAGGGTGAGTGTCTCAGCCTGGCCGTGTTGGAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    603 CTGGCCCGGATGGCGCGAGAGCAGGCCCAGCGGCCGGGAGAGCTGCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   5907 CTGGCCCGGATGGCGCGAGAGCAGGCCCAGCGGCCGGGAGAGCTGCTGAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    653 GACTGTCAG         CTACAAGGCCTGCCTACCCCCAAGCCTGCGCG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
   5957 GACTGTCAGGTG...CAGCTACAAGGCCTGCCTACCCCCAAGCCTGCGCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    694 ACCTGATCCAGGGCCTGAGCTTCGTGACGCGGAGG GCTATTCGGAGGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||-|-||||||||||||
   6414 ACCTGATCCAGGGCCTGAGCTTCGTGACGCGGAGGCG TATTCGGAGGAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    743 GGTGCGCAGAGCCCTGC CGCGCGTGGCCGCCTGCCAGGCAGACCGGCAC
        |||||||||||||||||-|-||||||||||||||||||||||||||||||
   6463 GGTGCGCAGAGCCCTGCGC CGCGTGGCCGCCTGCCAGGCAGACCGGCAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 TCGCTCATGGCCAAGTACATCATGGACCTGGAGCGGCTGGATCCAGCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   6512 TCGCTCATGGCCAAGTACATCATGGACCTGGAGCGGCTGGATCCAGCCGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 GGCCGCCGAGACCTTCCACGTGGGCCTCCCTGGGGCCCTTGGTGGCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   6562 GGCCGCCGAGACCTTCCACGTGGGCCTCCCTGGGGCCCTTGGTGGCCACG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 ACGGGCTGGGGCTGCTCCGCGTGGCTGGTGACGGCGGCATCGCCTGGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   6612 ACGGGCTGGGGCTGCTCCGCGTGGCTGGTGACGGCGGCATCGCCTGGACC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 CAGGGAGAACAGGAG         GTCCTCCAGCCCTTCTGCGACTTTCC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
   6662 CAGGGAGAACAGGAGGTG...CAGGTCCTCCAGCCCTTCTGCGACTTTCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 AGAAATCGTAGACATTAGCATCAAGCAGGCCCCGCGCGTTGGCCCGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   7256 AGAAATCGTAGACATTAGCATCAAGCAGGCCCCGCGCGTTGGCCCGGCCG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 GAGAGCACCGCCTGGTCACTGTTACCAGGACAGACAACCAGATTTTA   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
   7306 GAGAGCACCGCCTGGTCACTGTTACCAGGACAGACAACCAGATTTTAGTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1080       GAGGCCGAGTTCCCAGGGCTGCCCGAGGCTCTGTCGTTCGTGGC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   7356 ...CAGGAGGCCGAGTTCCCAGGGCTGCCCGAGGCTCTGTCGTTCGTGGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 GCTCGTGGACGGCTACTTCCGGCTGACCACGGACTCCCAGCACTTCTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   7490 GCTCGTGGACGGCTACTTCCGGCTGACCACGGACTCCCAGCACTTCTTCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 GCAAGGAGGTGGCACCGCCGAGGCTGCTGGAGGAAGTGGCCGAGCAGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   7540 GCAAGGAGGTGGCACCGCCGAGGCTGCTGGAGGAAGTGGCCGAGCAGTGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 CACGGCCCCATCAC         TCTGGACTTTGCCATCAACAAGCTCAA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
   7590 CACGGCCCCATCACGTA...CAGTCTGGACTTTGCCATCAACAAGCTCAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 GACTGGGGGCTCACGTCCTGGCTCCTATGTTCTCCGCCGCAGCCCCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   8678 GACTGGGGGCTCACGTCCTGGCTCCTATGTTCTCCGCCGCAGCCCCCAGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1315 ACTTTGACAGCTTCCTCCTCACTGTCTGTGTCCAG         AACCCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
   8728 ACTTTGACAGCTTCCTCCTCACTGTCTGTGTCCAGGTC...CAGAACCCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 CTTGGTCCTGATTATAAGGGCTGCCTCATCCGGCGCAGCCCCACAGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   9335 CTTGGTCCTGATTATAAGGGCTGCCTCATCCGGCGCAGCCCCACAGGAAC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 CTTCCTTCTGGTTGGCCTCAGCCGACCCCACAGCAGTCTTCGAGAGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   9385 CTTCCTTCTGGTTGGCCTCAGCCGACCCCACAGCAGTCTTCGAGAGCTCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 TGGCAACCTGCTGGGATGGGGGGCTGCACGTAGATGGGGTGGCAGTGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   9435 TGGCAACCTGCTGGGATGGGGGGCTGCACGTAGATGGGGTGGCAGTGACC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1506 CTCACTTCCTGCTGTATCCCCAGACCCAAAG         AAAAGTCCAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
   9485 CTCACTTCCTGCTGTATCCCCAGACCCAAAGGTG...TAGAAAAGTCCAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1547 CCTGATCGTGGTCCAGAGAGGTCACAGCCCACCCACATCATCCTTGGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  10612 CCTGATCGTGGTCCAGAGAGGTCACAGCCCACCCACATCATCCTTGGTTC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1597 AGCCCCAATCCCAATACCAGCTGAGTCAGATGACATTTCACAAGATCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  10662 AGCCCCAATCCCAATACCAGCTGAGTCAGATGACATTTCACAAGATCCCT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1647 GCTGACAGCCTGGAGTGG         CATGAGAACCTGGGCCATGGGTC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
  10712 GCTGACAGCCTGGAGTGGGTA...CAGCATGAGAACCTGGGCCATGGGTC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1688 CTTCACCAAGATTTACCGGGGCTGTCGCCATGAGGTGGTGGATGGGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  10952 CTTCACCAAGATTTACCGGGGCTGTCGCCATGAGGTGGTGGATGGGGAGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1738 CCCGAAAGACAGAGGTGCTGCTGAAGGTCATGGATGCCAAGCACAAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  11002 CCCGAAAGACAGAGGTGCTGCTGAAGGTCATGGATGCCAAGCACAAGAAC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1788 TGCATGGAG         TCATTCCTGGAAGCAGCGAGCTTGATGAGCCA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
  11052 TGCATGGAGGTG...CAGTCATTCCTGGAAGCAGCGAGCTTGATGAGCCA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1829 AGTGTCGTACCGGCATCTCGTGCTGCTCCACGGCGTGTGCATGGCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  11811 AGTGTCGTACCGGCATCTCGTGCTGCTCCACGGCGTGTGCATGGCTGGAG

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1879 ACA         GCACCATGGTGCAGGAATTTGTACACCTGGGGGCCATA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  11861 ACAGTG...CAGGCACCATGGTGCAGGAATTTGTACACCTGGGGGCCATA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1920 GACATGTATCTGCGAAAACGTGGCCACCTGGTGCCAGCCAGCTGGAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  12979 GACATGTATCTGCGAAAACGTGGCCACCTGGTGCCAGCCAGCTGGAAGCT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1970 GCAGGTGGTCAAACAGCTGGCCTACGCCCTCAACTATCTG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
  13029 GCAGGTGGTCAAACAGCTGGCCTACGCCCTCAACTATCTGGTG...TAGG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2011 AGGACAAAGGCCTGCCCCATGGCAATGTCTCTGCCCGGAAGGTGCTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  13778 AGGACAAAGGCCTGCCCCATGGCAATGTCTCTGCCCGGAAGGTGCTCCTG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2061 GCTCGGGAGGGGGCTGATGGGAGCCCGCCCTTCATCAAGCTGAGTGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  13828 GCTCGGGAGGGGGCTGATGGGAGCCCGCCCTTCATCAAGCTGAGTGACCC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2111 TGGGGTCAGCCCCGCTGTGTTAAGCCTGGAGA         TGCTCACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
  13878 TGGGGTCAGCCCCGCTGTGTTAAGCCTGGAGAGTA...CAGTGCTCACCG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2152 ACAGGATCCCCTGGGTGGCCCCCGAGTGTCTCCGGGAGGCGCAGACACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  13998 ACAGGATCCCCTGGGTGGCCCCCGAGTGTCTCCGGGAGGCGCAGACACTT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2202 AGCTTGGAAGCTGACAAGTGGGGCTTCGGCGCCACGGTCTGGGAAGTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  14048 AGCTTGGAAGCTGACAAGTGGGGCTTCGGCGCCACGGTCTGGGAAGTGTT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2252 TAGTGGCGTCACCATGCCCATCAGTGCCCTGGATCCTGCTAAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
  14098 TAGTGGCGTCACCATGCCCATCAGTGCCCTGGATCCTGCTAAGGTC...C

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2295   AAACTCCAATTTTATGAGGACCGGCAGCAGCTGCCGGCCCCCAAGTGG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  14269 AGAAACTCCAATTTTATGAGGACCGGCAGCAGCTGCCGGCCCCCAAGTGG

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2343 ACAGAGCTGGCCCTGCTGATTCAACAGTGCATGGCCTATGAGCCGGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  14319 ACAGAGCTGGCCCTGCTGATTCAACAGTGCATGGCCTATGAGCCGGTCCA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2393 GAGGCCCTCCTTCCGAGCCGTCATTCGTGACCTCAATAGCCTCATCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  14369 GAGGCCCTCCTTCCGAGCCGTCATTCGTGACCTCAATAGCCTCATCTCTT

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2443 CAG         ACTATGAGCTCCTCTCAGACCCCACACCTGGTGCCCTG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  14419 CAGGTG...CAGACTATGAGCTCCTCTCAGACCCCACACCTGGTGCCCTG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2484 GCACCTCGTGATGGGCTGTGGAATGGTGCCCAGCTCTATGCCTGCCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  16101 GCACCTCGTGATGGGCTGTGGAATGGTGCCCAGCTCTATGCCTGCCAAGA

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2534 CCCCACGATCTTCGAGGAGAGACACCTCAAGTACATCTCACAGCTGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  16151 CCCCACGATCTTCGAGGAGAGACACCTCAAGTACATCTCACAGCTGGGCA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2584 AG         GGCAACTTTGGCAGCGTGGAGCTGTGCCGCTATGACCCG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  16201 AGGTA...CAGGGCAACTTTGGCAGCGTGGAGCTGTGCCGCTATGACCCG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2625 CTAGCCCACAATACAGGTGCCCTGGTGGCCGTGAAACAGCTGCAGCACAG
        |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  16323 CTAGGCGACAATACAGGTGCCCTGGTGGCCGTGAAACAGCTGCAGCACAG

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2675 CGGGCCAGACCAGCAGAGGGACTTTCAGCGGGAGATTCAGATCCTCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  16373 CGGGCCAGACCAGCAGAGGGACTTTCAGCGGGAGATTCAGATCCTCAAAG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2725 CACTGCACAGTGATTTCATTGTCAAGTATCGTGGTGTCAGCTATGGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  16423 CACTGCACAGTGATTTCATTGTCAAGTATCGTGGTGTCAGCTATGGCCCG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2775 G         GCCGGCCAGAGC TGCGGCTGGTCATGGAGTACCTGCCCA
        |>>>...>>>|||-||||||||-|||||||||||||||||||||||||||
  16473 GGTG...CAGGCC GCCAGAGCCTGCGGCTGGTCATGGAGTACCTGCCCA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2815 GCGGCTGCTTGCGCGACTTCCTGCAGCGGCACCGCGCGCGCCTCGATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  17233 GCGGCTGCTTGCGCGACTTCCTGCAGCGGCACCGCGCGCGCCTCGATGCC

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2865 AGCCGCCTCCTTCTCTATTCCTCGCAGATCTGCAAG         GGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
  17283 AGCCGCCTCCTTCTCTATTCCTCGCAGATCTGCAAGGTG...CAGGGCAT

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2906 GGAGTACCTGGGCTCCCGCCGCTGCGTGCACCGCGACCTGGCCGCCCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  17597 GGAGTACCTGGGCTCCCGCCGCTGCGTGCACCGCGACCTGGCCGCCCGAA

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2956 ACATCCTCGTGGAGAGCGAGGCACACGTCAAGATCGCTGACTTCGGCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  17647 ACATCCTCGTGGAGAGCGAGGCACACGTCAAGATCGCTGACTTCGGCCTA

   3100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3006 GCTAAGCTGCTGCCGCTTGACAAAGACTACTACGTGGTCCGCGAGCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  17697 GCTAAGCTGCTGCCGCTTGACAAAGACTACTACGTGGTCCGCGAGCCAGG

   3150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3056 CCAGAGCCCCATTTTCTG         GTATGCCCCCGAATCCCTCTCGG
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
  17747 CCAGAGCCCCATTTTCTGGTG...CAGGTATGCCCCCGAATCCCTCTCGG

   3200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3097 ACAACATCTTCTCTCGCCAGTCAGACGTCTGGAGCTTCGGGGTCGTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  18395 ACAACATCTTCTCTCGCCAGTCAGACGTCTGGAGCTTCGGGGTCGTCCTG

   3250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3147 TACGAGCTCTTCACCTACTGCGACAAAAGCTGCAGCCCCTCGGCC     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
  18445 TACGAGCTCTTCACCTACTGCGACAAAAGCTGCAGCCCCTCGGCCGTG..

   3300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3192     GAGTTCCTGCGGATGATGGGATGTGAGCGGGATGTCCCCGCCCTCT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  18495 .CAGGAGTTCCTGCGGATGATGGGATGTGAGCGGGATGTCCCCGCCCTCT

   3350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3238 GCCGCCTCTTGGAACTGCTGGAGGAGGGCCAGAGGCTGCCGGCGCCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  18820 GCCGCCTCTTGGAACTGCTGGAGGAGGGCCAGAGGCTGCCGGCGCCTCCT

   3400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3288 GCCTGCCCTGCTGAG         GTTCACGAGCTCATGAAGCTGTGCTG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
  18870 GCCTGCCCTGCTGAGGTG...CAGGTTCACGAGCTCATGAAGCTGTGCTG

   3450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3329 GGCCCCTAGCCCACAGGACCGGCCATCATTCAGCGCCCTGGGCCCCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  22108 GGCCCCTAGCCCACAGGACCGGCCATCATTCAGCGCCCTGGGCCCCCAGC

   3500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3379 TGGACATGCTGTGGAGCGGAAGCCGGGGGTGTGAGACTCATGCCTTCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  22158 TGGACATGCTGTGGAGCGGAAGCCGGGGGTGTGAGACTCATGCCTTCACT

   3550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3429 GCTCACCCAGAGGGCAAACACCACTCCCTGTCCTTTTCATAGCTCCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  22208 GCTCACCCAGAGGGCAAACACCACTCCCTGTCCTTTTCATAGCTCCTGCC

   3600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3479 CGCAGACCTCTGGATTAGGTCTCTGTTGACTGGCTGTGTGACCTTAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  22258 CGCAGACCTCTGGATTAGGTCTCTGTTGACTGGCTGTGTGACCTTAGGCC

   3650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3529 CGGAGCTGCCCCTCTCTGGGCCTCAGAGGCCTTATGAGGGTCCTCTACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  22308 CGGAGCTGCCCCTCTCTGGGCCTCAGAGGCCTTATGAGGGTCCTCTACTT

   3700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3579 CAGGAACACCCCCATGACATTGCATTTGGGGGGGCTCCCGTGGCCTGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  22358 CAGGAACACCCCCATGACATTGCATTTGGGGGGGCTCCCGTGGCCTGTAG

   3750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3629 AATAGCCTGTGGCCTTTGCAATTTGTTAAGGTTCAAGACAGATGGGCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  22408 AATAGCCTGTGGCCTTTGCAATTTGTTAAGGTTCAAGACAGATGGGCATA

   3800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3679 TGTGTCAGTGGGGCTCTCTGAGTCCTGGCCCAAAGAAGCAAGGAACCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  22458 TGTGTCAGTGGGGCTCTCTGAGTCCTGGCCCAAAGAAGCAAGGAACCAAA

   3850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3729 TTTAAGACTCTCGCATCTTCCCAACCCCTTAAGCCCTGGCCCCCTGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  22508 TTTAAGACTCTCGCATCTTCCCAACCCCTTAAGCCCTGGCCCCCTGAGTT

   3900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3779 TCCTTTTCTCGTCTCTCTCTTTTTATTTTTTTTATTTTTATTTTTATTTT
        |||||||||-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  22558 TCCTTTTCT GTCTCTCTCTTTTTATTTTTTTTATTTTTATTTTTATTTT

   3950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3829 TGAGACAGAGCCTCGCTC GTTACCCAGGGTGGAGTGCAGTGGTAGCGAT
        ||||||||||||||||||-|||||||||||||||||||||||||-|||||
  22607 TGAGACAGAGCCTCGCTCTGTTACCCAGGGTGGAGTGCAGTGGT GCGAT

   4000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3878 CTCGGCTCACAGTGCAACCTCTGCTTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGC
        |||||||--|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  22656 CTCGGCT  CAGTGCAACCTCTGCTTCCCAGGTTCAAGCGATTCTCCTGC

   4050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3928 CTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTGTGCACCACCACACCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  22704 CTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGTGTGCACCACCACACCCGGC

   4100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   3978 TAATTTTTTTTATTTTTAATAGAGATGAGGTTTCACCATGATGGCCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  22754 TAATTTTTTTTATTTTTAATAGAGATGAGGTTTCACCATGATGGCCAGGC

   4150     .    :    .    :    .    :    .
   4028 TGATCTCGAACTCCTAACCTCAAGTGATCCTCCCACC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  22804 TGATCTCGAACTCCTAACCTCAAGTGATCCTCCCACC