seq1 = /home/httpd/html/group-files/cgi-bin/cDNA_fasta.txt, 2817 bp
seq2 = /home/httpd/html/group-files/cgi-bin/DNA_fasta.txt (AY186092), 33033 bp

>AF155118
>AY186092

1-40  (1894-1933)   100% ->
41-210  (11040-11209)   100% ->
211-356  (14157-14302)   100% ->
357-539  (15117-15299)   100% ->
540-700  (15849-16009)   100% ->
701-765  (16902-16966)   100% ->
766-880  (20567-20681)   100% ->
881-990  (21130-21239)   100% ->
991-1174  (25244-25427)   100% ->
1175-1237  (26599-26661)   100% ->
1238-1396  (29336-29494)   97% ->
1397-2817  (29617-31033)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 GTTCTTCTGTCGCCGGCTTCAGCAGCCCGCGCCCGGGCAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
   1894 GTTCTTCTGTCGCCGGCTTCAGCAGCCCGCGCCCGGGCAGGTA...TAGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 AATAGAAGATGAACAAACCCATAACACCATCAACATATGTGCGCTGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  11041 AATAGAAGATGAACAAACCCATAACACCATCAACATATGTGCGCTGCCTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AATGTTGGACTAATTAGGAAGCTGTCAGATTTTATTGATCCTCAAGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  11091 AATGTTGGACTAATTAGGAAGCTGTCAGATTTTATTGATCCTCAAGAAGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATGGAAGAAGTTAGCTGTAGCTATTAAAAAACCATCTGGTGATGATAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  11141 ATGGAAGAAGTTAGCTGTAGCTATTAAAAAACCATCTGGTGATGATAGAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ACAATCAGTTTCACATAAG         GAGATTTGAAGCATTACTTCAA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
  11191 ACAATCAGTTTCACATAAGGTA...AAGGAGATTTGAAGCATTACTTCAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACTGGAAAAAGTCCCACTTCTGAATTACTGTTTGACTGGGGCACCACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  14179 ACTGGAAAAAGTCCCACTTCTGAATTACTGTTTGACTGGGGCACCACAAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TTGCACAGTTGGTGATCTTGTGGATCTTTTGATCCAAAATGAATTTTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  14229 TTGCACAGTTGGTGATCTTGTGGATCTTTTGATCCAAAATGAATTTTTTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CTCCTGCGAGTCTTTTGCTCCCAG         ATGCTGTTCCCAAAACT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
  14279 CTCCTGCGAGTCTTTTGCTCCCAGGTA...TAGATGCTGTTCCCAAAACT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GCTAATACACTACCTTCTAAAGAAGCTATAACAGTTCAGCAAAAACAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  15134 GCTAATACACTACCTTCTAAAGAAGCTATAACAGTTCAGCAAAAACAGAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GCCTTTCTGTGACAAAGACAGGACATTGATGACACCTGTGCAGAATCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  15184 GCCTTTCTGTGACAAAGACAGGACATTGATGACACCTGTGCAGAATCTTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AACAAAGCTATATGCCACCTGACTCCTCAAGTCCAGAAAATAAAAGTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  15234 AACAAAGCTATATGCCACCTGACTCCTCAAGTCCAGAAAATAAAAGTTTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GAAGTTAGTGATACAC         GTTTTCACAGTTTTTCATTTTATGA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
  15284 GAAGTTAGTGATACACGTA...TAGGTTTTCACAGTTTTTCATTTTATGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ATTGAAGAATGTCACAAATAACTTTGATGAACGACCCATTTCTGTTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  15874 ATTGAAGAATGTCACAAATAACTTTGATGAACGACCCATTTCTGTTGGTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GTAATAAAATGGGAGAGGGAGGATTTGGAGTTGTATATAAAGGCTACGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  15924 GTAATAAAATGGGAGAGGGAGGATTTGGAGTTGTATATAAAGGCTACGTA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AATAACACAACTGTGGCAGTGAAGAAGCTTGCAGCA         ATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
  15974 AATAACACAACTGTGGCAGTGAAGAAGCTTGCAGCAGTA...CAGATGGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TGACATTACTACTGAAGAACTGAAACAGCAGTTTGATCAAGAAATAAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  16907 TGACATTACTACTGAAGAACTGAAACAGCAGTTTGATCAAGAAATAAAAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TAATGGCAAA         GTGTCAACATGAAAACTTAGTAGAACTACTT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
  16957 TAATGGCAAAGTA...CAGGTGTCAACATGAAAACTTAGTAGAACTACTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 GGTTTCTCAAGTGATGGAGATGACCTCTGCTTAGTATATGTTTACATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  20598 GGTTTCTCAAGTGATGGAGATGACCTCTGCTTAGTATATGTTTACATGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 TAATGGTTCATTGCTAGACAGACTCTCTTGCTTG         GATGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
  20648 TAATGGTTCATTGCTAGACAGACTCTCTTGCTTGGTA...AAGGATGGTA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CTCCACCACTTTCTTGGCACATGAGATGCAAGATTGCTCAGGGTGCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  21137 CTCCACCACTTTCTTGGCACATGAGATGCAAGATTGCTCAGGGTGCAGCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 AATGGCATCAATTTTCTACATGAAAATCATCATATTCATAGAGATATTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  21187 AATGGCATCAATTTTCTACATGAAAATCATCATATTCATAGAGATATTAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 AAG         TGCAAATATCTTACTGGATGAAGCTTTTACTGCTAAAA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  21237 AAGGTA...CAGTGCAAATATCTTACTGGATGAAGCTTTTACTGCTAAAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 TATCTGACTTTGGCCTTGCACGGGCTTCTGAGAAGTTTGCCCAGACAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  25282 TATCTGACTTTGGCCTTGCACGGGCTTCTGAGAAGTTTGCCCAGACAGTC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 ATGACTAGCAGAATTGTGGGAACAACAGCTTATATGGCACCAGAAGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  25332 ATGACTAGCAGAATTGTGGGAACAACAGCTTATATGGCACCAGAAGCTTT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 GCGTGGAGAAATAACACCCAAATCTGATATTTACAGCTTTGGTGTG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
  25382 GCGTGGAGAAATAACACCCAAATCTGATATTTACAGCTTTGGTGTGGTA.

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1175      GTTTTACTAGAAATAATAACTGGACTTCCAGCTGTGGATGAACAC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  25432 ..TAGGTTTTACTAGAAATAATAACTGGACTTCCAGCTGTGGATGAACAC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 CGTGAACCTCAGTTATTG         CTAGATATTAAAGAAGAAATTGA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
  26644 CGTGAACCTCAGTTATTGGTA...AAGCTAGATATTAAAGAAGAAATTGA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 AGATGAAGAAAAGACAATTGAAGATTATATTGATAAAAAGATGAATGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  29359 AGATGAAGAAAAGACAATTGAAGATTATATTGATAAAAAGATGAATGATG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 CTGATTCCACTTCAGTTGAAGCTATGTACTCTGGTGCTAGCCAATGTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |
  29409 CTGATTCCACTTCAGTTGAAGCTATGTACTCTGTTGCTAGTCAATGTCTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 CATGAAAAGAAAAATAAGAGCCCAGACATTAAGAAG         GTTCA
        |||||||||||||||||||| |||||||||||||||>>>...>>>|||||
  29459 CATGAAAAGAAAAATAAGAGACCAGACATTAAGAAGGTA...AAGGTTCA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 CCAGCTGCTGCAAGAGATGACAGCTTCTTAAAACTTTATTGAAAAAGACT
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
  29622 ACAGCTGCTGCAAGAGATGACAGCTTCTTAAAACTTTATTGGAAAAGACT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 CTTGACTTTTTATATACACCTATCTCAACCATTTTTTTAACTGATTTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  29672 CTTGACTTTTTATATACACCTATCTCAACCATTTTTTTAACTGATTTTTT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 TCCTAAATATTCTTCTTTACCTTTAACAAGGCATAGGCTGTTGCAGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  29722 TCCTAAATATTCTTCTTTACCTTTAACAAGGCATAGGCTGTTGCAGGACA

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 GTGGTTATTAAAGCATGGGTTGAACTTCCAAAATATAAAAATAGAGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  29772 GTGGTTATTAAAGCATGGGTTGAACTTCCAAAATATAAAAATAGAGCCAC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 CATATCAACACTTAGCCCTACCCATTAGTATCACCCCCAGTTCTTACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  29822 CATATCAACACTTAGCCCTACCCATTAGTATCACCCCCAGTTCTTACAGT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 AATCCCTGAGAAATCTCCTTCAAGCATCACCAAACACAGTTTGAAAATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  29872 AATCCCTGAGAAATCTCCTTCAAGCATCACCAAACACAGTTTGAAAATTA

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 CAGGGTTAGCAAAAAGAGCCTGGGCTGTATGTAGGGTGGAAACACTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  29922 CAGGGTTAGCAAAAAGAGCCTGGGCTGTATGTAGGGTGGAAACACTCTGA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 TCTGAAGCCCAGCTGACTCCACTACTAATTTGCTGTAAAGCTTTGGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  29972 TCTGAAGCCCAGCTGACTCCACTACTAATTTGCTGTAAAGCTTTGGACAT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 ACACTTAGCTGCTGTGAGCCACTAATAACATTGGGCTAATATCTGCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  30022 ACACTTAGCTGCTGTGAGCCACTAATAACATTGGGCTAATATCTGCTGTG

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1852 CTTCTCTGACAGGTAGTCATGAAAATCAAATGATGCAAAATATATACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  30072 CTTCTCTGACAGGTAGTCATGAAAATCAAATGATGCAAAATATATACAAG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1902 CACTTTGTAAATTGTAAAATGATACAAAATTTAAAGTTTATAGAGCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  30122 CACTTTGTAAATTGTAAAATGATACAAAATTTAAAGTTTATAGAGCCAGT

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1952 TACAAAATCCTATTAGTCATATATTTATAGATTGTGTTCACAGCAATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  30172 TACAAAATCCTATTAGTCATATATTTATAGATTGTGTTCACAGCAATCAT

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2002 TTAACCACAAATAAAATATCCCTTGATGATACTGCCATAATGATATGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  30222 TTAACCACAAATAAAATATCCCTTGATGATACTGCCATAATGATATGTCC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2052 ATTATTAGATTATGTTACATGACAAAGTTGAAGGAATTTGGCAGATGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  30272 ATTATTAGATTATGTTACATGACAAAGTTGAAGGAATTTGGCAGATGCAG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2102 TTAAGGTTCCTAAACAACTCACTTTGAGACTGTTGAAAGGGCCTGACCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  30322 TTAAGGTTCCTAAACAACTCACTTTGAGACTGTTGAAAGGGCCTGACCTA

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2152 ATCCAAGTGAACCCCTTGCAAGAAGAATTCTCCTTGTAAGCCTTGAAGAA
        |||-||||||||||-|||||||||||||||||||||||||||||||||||
  30372 ATC AAGTGAACCC TTGCAAGAAGAATTCTCCTTGTAAGCCTTGAAGAA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2202 GTATGTGAGAGGGCCACATTGGCTAAAACCTAAAGGTGGCCTCTAGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  30420 GTATGTGAGAGGGCCACATTGGCTAAAACCTAAAGGTGGCCTCTAGGAGA

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2252 TGAGACCTACCTTCCAGTTGTCAGCAAGCAGGAAAAAAAAATTGGGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  30470 TGAGACCTACCTTCCAGTTGTCAGCAAGCAGGAAAAAAAAATTGGGACCT

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2302 CAGTTGCAACCACAAGGAACTGAATTCTGCCAAAAATCTGAGTCAGCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  30520 CAGTTGCAACCACAAGGAACTGAATTCTGCCAAAAATCTGAGTCAGCTTA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2352 GAAGAGTACTCCAAGCTTCAGATGATAACCACAGCCTGGGCTGACACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  30570 GAAGAGTACTCCAAGCTTCAGATGATAACCACAGCCTGGGCTGACACCTG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2402 GATTTCAGCTTTGCATGATCCTCAGTATGAGAATCTATCTGTTCTGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  30620 GATTTCAGCTTTGCATGATCCTCAGTATGAGAATCTATCTGTTCTGTGCT

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2452 GGACTTCTAATATATAGAACTGTGAGATAATGGGTCACATTGGCTGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  30670 GGACTTCTAATATATAGAACTGTGAGATAATGGGTCACATTGGCTGGATG

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2502 TGGTGGCTCATACCTGTAAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  30720 TGGTGGCTCATACCTGTAAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGCA

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2552 GATCACCTGAGGTCAAGAGTTCAAGACCGGCCTGGCCAACATGGTGAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  30770 GATCACCTGAGGTCAAGAGTTCAAGACCGGCCTGGCCAACATGGTGAAAC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2602 CCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGACGAGCGTGGTGGTGGACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  30820 CCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGACGAGCGTGGTGGTGGACACC

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2652 TGTAGTCCCAGCTGCTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGACTAGCTGGAACCAG
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  30870 TGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGACTAGCTGGAACCAG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2702 GGAGGTAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  30920 GGAGGTAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGTGCCACTGCACTCCAGCCTG

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2752 GGTGACAGAGTGAGACTCCATCATAAATAAATAAATAAATAAATGGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
  30970 GGTGACAGAGTGAGACTCCATCATAAATAAATAAATAAATAAATGGGTCA

   2900     .    :    .
   2802 CATTAAGCCTTTAAAA
        ||||||||||||||--
  31020 CATTAAGCCTTTAA